Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lipo1J3QME6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lipo1J3QME6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lipo1J3QME6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lipo1J3QME6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms