Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20825J3QM67 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20825J3QM67 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20825J3QM67 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20825J3QM67 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20825J3QM67 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20825J3QM67 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20825J3QM67 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20825J3QM67 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20825J3QM67 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20825J3QM67 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms