Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem200cJ3QK46 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem200cJ3QK46 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem200cJ3QK46 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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