Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
7530416G11RikJ3QJX6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
7530416G11RikJ3QJX6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms