Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r194J3JS27 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r194J3JS27 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r194J3JS27 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms