Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20696H3BJN7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20696H3BJN7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20696H3BJN7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms