Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf4bG5E8Z2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Taf4bG5E8Z2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf4bG5E8Z2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms