Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hmgxb3G3X9M3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms