Protein–RNA interactions for Protein: G3UY92

Vmn1r158, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r158G3UY92 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r158G3UY92 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r158G3UY92 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r158G3UY92 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r158G3UY92 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r158G3UY92 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r158G3UY92 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r158G3UY92 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r158G3UY92 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r158G3UY92 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r158G3UY92 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r158G3UY92 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r158G3UY92 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r158G3UY92 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r158G3UY92 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms