Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Colca2F8VPY8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Colca2F8VPY8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Colca2F8VPY8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms