Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp9yF8VPU6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp9yF8VPU6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp9yF8VPU6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms