Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ttc37F8VPK0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ttc37F8VPK0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ttc37F8VPK0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ttc37F8VPK0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ttc37F8VPK0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ttc37F8VPK0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ttc37F8VPK0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ttc37F8VPK0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Ttc37F8VPK0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Ttc37F8VPK0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Ttc37F8VPK0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ttc37F8VPK0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ttc37F8VPK0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ttc37F8VPK0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms