Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm28048F7BCN0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28048F7BCN0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms