Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8444F6XS56 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8444F6XS56 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8444F6XS56 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms