Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc141E9Q8Q6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc141E9Q8Q6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms