Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4X4

Vmn2r11, Vomeronasal 2, receptor 11, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r11E9Q4X4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r11E9Q4X4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r11E9Q4X4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r11E9Q4X4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms