Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C2cd2E9Q3C1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2cd2E9Q3C1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms