Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp3E9Q1T6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp3E9Q1T6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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