Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1N7

Gm8126, Predicted gene 8126, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8126E9Q1N7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gm8126E9Q1N7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm8126E9Q1N7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm8126E9Q1N7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Gm8126E9Q1N7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Gm8126E9Q1N7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Gm8126E9Q1N7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm8126E9Q1N7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms