Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1N7

Gm8126, Predicted gene 8126, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8126E9Q1N7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm8126E9Q1N7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Gm8126E9Q1N7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8126E9Q1N7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Gm8126E9Q1N7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm8126E9Q1N7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8126E9Q1N7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Gm8126E9Q1N7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Gm8126E9Q1N7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm8126E9Q1N7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm8126E9Q1N7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm8126E9Q1N7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms