Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930426L09RikE9Q0N7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930426L09RikE9Q0N7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930426L09RikE9Q0N7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930426L09RikE9Q0N7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930426L09RikE9Q0N7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930426L09RikE9Q0N7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930426L09RikE9Q0N7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930426L09RikE9Q0N7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930426L09RikE9Q0N7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930426L09RikE9Q0N7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930426L09RikE9Q0N7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930426L09RikE9Q0N7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms