Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc17E9PVB5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc17E9PVB5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc17E9PVB5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms