Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zfp839E9PUU5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp839E9PUU5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp839E9PUU5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp839E9PUU5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp839E9PUU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp839E9PUU5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp839E9PUU5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp839E9PUU5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp839E9PUU5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp839E9PUU5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms