Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmed7D3YZZ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed7D3YZZ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed7D3YZZ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms