Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SafbD3YXK2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SafbD3YXK2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SafbD3YXK2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SafbD3YXK2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SafbD3YXK2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms