Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK6

Vmn2r27, Vomeronasal 2, receptor27, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r27D3YUK6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r27D3YUK6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn2r27D3YUK6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r27D3YUK6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms