Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxpe3B9EKK6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxpe3B9EKK6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nxpe3B9EKK6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxpe3B9EKK6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.1 ms