Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp26c1B2RXA7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp26c1B2RXA7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms