Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usf3B2RUQ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms