Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud4B2RRE7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud4B2RRE7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms