Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp42B2RQC2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp42B2RQC2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp42B2RQC2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms