Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp40B1B1D3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp40B1B1D3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp40B1B1D3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp40B1B1D3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp40B1B1D3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp40B1B1D3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp40B1B1D3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms