Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap3aB1AWZ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms