Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M5A7VMS3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-M5A7VMS3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms