Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2c2A7L9Z8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2c2A7L9Z8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2c2A7L9Z8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2c2A7L9Z8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2c2A7L9Z8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2c2A7L9Z8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2c2A7L9Z8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2c2A7L9Z8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2c2A7L9Z8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2c2A7L9Z8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms