Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Odf2A3KGV1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Odf2A3KGV1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms