Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5640A3KG49 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5640A3KG49 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms