Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CatsperbA2RTF1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperbA2RTF1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperbA2RTF1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms