Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Upf2A2AT37 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Upf2A2AT37 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Upf2A2AT37 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms