Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd60A2AMD2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd60A2AMD2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd60A2AMD2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd60A2AMD2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd60A2AMD2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd60A2AMD2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd60A2AMD2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd60A2AMD2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ankrd60A2AMD2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ankrd60A2AMD2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd60A2AMD2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd60A2AMD2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd60A2AMD2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms