Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lcn6A2AJB9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lcn6A2AJB9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lcn6A2AJB9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms