Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a3A2ACT7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a3A2ACT7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col9a3A2ACT7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a3A2ACT7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms