Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgb4A2A863 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Itgb4A2A863 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb4A2A863 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb4A2A863 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms