Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms