Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Gm28171A0A087WQ19 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gm28171A0A087WQ19 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Gm28171A0A087WQ19 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gm28171A0A087WQ19 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gm28171A0A087WQ19 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gm28171A0A087WQ19 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gm28171A0A087WQ19 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gm28171A0A087WQ19 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Gm28171A0A087WQ19 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Gm28171A0A087WQ19 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Gm28171A0A087WQ19 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Gm28171A0A087WQ19 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28171A0A087WQ19 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Gm28171A0A087WQ19 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm28171A0A087WQ19 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Gm28171A0A087WQ19 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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