Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt27Q9Z320 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt27Q9Z320 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt27Q9Z320 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms