Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C8

Ybx2, Y-box-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx2Q9Z2C8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx2Q9Z2C8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ybx2Q9Z2C8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ybx2Q9Z2C8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ybx2Q9Z2C8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms