Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trip6Q9Z1Y4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trip6Q9Z1Y4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms