Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Arid3bQ9Z1N7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arid3bQ9Z1N7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arid3bQ9Z1N7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Arid3bQ9Z1N7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms