Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Nup160Q9Z0W3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Nup160Q9Z0W3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Nup160Q9Z0W3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Nup160Q9Z0W3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Nup160Q9Z0W3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Nup160Q9Z0W3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Nup160Q9Z0W3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Nup160Q9Z0W3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms