Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrknQ9WVS6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrknQ9WVS6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PrknQ9WVS6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PrknQ9WVS6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrknQ9WVS6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrknQ9WVS6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrknQ9WVS6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms